Amaury Chaves de Athayde nasceu em Curitiba, Paraná, no dia 10 de dezembro de 1945. Cursou a Faculdade de Direito de Curitiba, colando grau em 12 de fevereiro de 1971. No ano seguinte deu início ao magistério jurídico, na mesma instituição. Entre 1973 e 1975 atuou na Faculdade de Comércio Exterior (FACex), igualmente situada na Capital Paranaense. Lecionou a disciplina de Direito Público no Instituto Brasileiro de Administração Municipal (IBAM), no Rio de Janeiro entre 1984 e 1986.
Advogou entre fevereiro de 1971 e março de 1987, quando então assumiu o cargo de procurador do estado do Rio de Janeiro, após ser habilitado em concurso público. Exerceu o cargo em Nova Friburgo (RJ), junto à 8ª Procuradoria Regional, no período de 09 março de 1987 a 26 de fevereiro de 1988.
Aprovado em concurso público de provas e títulos promovido pelo Tribunal Federal de Recursos para o cargo de juiz federal, mediante Decreto presidencial de 02/02/1988, publicado no DOU de 03/02/1988, Amaury Chaves de Athayde foi inicialmente designado para a Vara Única de Santarém, na Seção Judiciária do Estado do Pará. Ingressou na magistratura em 26 de fevereiro de 1988, como titular. A Vara para a qual fora inicialmente designado não se encontrava ainda instalada, todavia, motivo pelo qual, por intermédio do Ato nº 155, da mesma data, o presidente do Conselho da Justiça Federal, ministro Evandro Gueiros Leite, determinou que prestasse auxílio junto à 4ª Vara da Seção Judiciária do Rio de Janeiro. Na mesma Seccional exerceu a titularidade na 3ª Vara Federal de Niterói e na 26ª Vara Federal do Rio de Janeiro (RJ).
Removido, a partir de fevereiro de 1989 passou a atuar na Seção Judiciária do Paraná (SJPR). Foi titular, sucessivamente, na 10ª e na 1ª Varas Federais, ambas em Curitiba, além de jurisdicionar eventualmente em Varas de Foz do Iguaçu e de Londrina. Foi designado para exercer o cargo de Vice-Diretor do Foro da SJPR, por um ano, a contar de janeiro de 1995; no mês de junho, contudo, passou a Diretor do Foro, sucedendo o juiz federal Manoel Eugênio Marques Munhoz até o final do período. Entre 1993-1994 foi juiz suplente do Tribunal Regional Eleitoral (TRE) do Paraná. Nos termos da Lei nº 8.713/93, desempenhou as funções de juiz auxiliar nas eleições de 1994. Em sessão plenária realizada em 30 de junho de 1995, no TRF4, foi eleito membro titular do TRE/PR, na classe dos juízes federais, para o biênio 1995-1997.
Em duas ocasiões atuou como juiz convocado junto ao Tribunal Regional Federal da 4ª Região. Em 05 de fevereiro de 1997 tomou posse como membro definitivo do TRF4, em vaga decorrente da aposentadoria do desembargador federal José Almada de Souza. Integrou o Conselho de Administração como suplente (2003-2004) e titular (2004-2005)
Presidiu a 4ª Turma de junho de 2001 a maio de 2006. Integrou o Conselho de Administração como suplente (2003-2004) e titular (2004-2005). Foi também suplente também das comissões examinadoras dos XII e XIII Concursos Públicos para Juiz Federal Substituto promovidos pelo Tribunal. Eleito como Vice-Presidente em sessão plenária realizada em 31 de maio de 2006, e com investidura no cargo na mesma data, completou o biênio da Administração que expiraria em 21 de junho de 2007, em decorrência da vacância ocorrida pela posse da então vice-presidente, Maria Lúcia Luz Leiria, como presidente do Tribunal, em vista da aposentadoria do titular do cargo, desembargador federal Nylson Paim de Abreu.
Em junho de 2017 passou a compor a Turma Regional Suplementar paranaense do Tribunal Regional Federal da 4ª Região - criada pela Resolução nº 34/2017 - competente para julgamento de recursos em matéria previdenciária e de assistência social originários daquele estado.
O desembargador Amaury Chaves de Athayde faleceu em fevereiro de 2018, ainda no exercício do cargo, aos 72 anos de idade. O TRF4 decretou luto oficial de três dias no âmbito da 4ª Região.
